台湾银行已经可以到大陆设办事处，但大陆银行一直无法赴台设办事处。大陆方面认为未符双边互惠原则而多有微辞。
据悉，台湾方面已授权主管机关订定办法，规范陆资来台投资的资格、条件等，相关单位并有共识，将大陆银行来台设立办事处，列入第一阶段开放陆资来台投资项目中，“金管会”已配合“陆委会”作相关开放的规划。
目前大陆方面已有招商、工银亚洲、上海浦东发展及兴业银行等四家银行，已表达意愿并已获大陆批准赴台设立办事处。其中，浦发银行和招商银行是大陆上市银行。工银亚洲是中国工商银行旗下公司，而工商银行是中国最大的四家国有商业银行之一。
另一方面，有多家台湾银行已在大陆设立代表处，其中彰化银行代表处设在昆山；世华银行、土地银行、第一商业银行代表处设在上海；中国信托商业银行、合作金库银行的代表处设在北京；华南银行代表处设在深圳。
在2001年以前，由于台当局禁止两岸银行直接往来，因此必须通过第三地、第三方两岸才可办理通汇及信用证等银行业务。
2001年8月，台当局开始分阶段开放台湾本地银行的离岸业务分行(OBU)办理两岸金融业务往来，大陆银行立即积极与台湾银行交换密押，互开帐户，办理两岸间的直接通汇业务。
2003年4月，台“财政部金融局”同意岛内本土业务分行(DBU)可与大陆银行直接往来，但初期只限于进出口押汇及汇出汇入款业务。其中，中国建设银行作为首批获准与台湾地区银行建立代理行关系的大陆银行，已和56家台湾银行(包括33家台湾本地银行和23家外资银行台湾地区分行)创建全面直接通汇业务渠道。
