第一，应加强基础技术和前沿技术研究。萧灼基指出，技术创新应从头抓起，从基础着手，就国家的整体科技规划而言，应特别重视基础研究。「不能只顾及短期利益，只研究应用技术，基础不打好就很难进行尖端技术研究。」
第二，应拓展对技术的原始创新、集成创新、消化吸收再创新。他指出，原先我们在创新技术力量薄弱的情况下，比较重视引进技术进行吸收消化，下来应把重点放在技术的原始创新上，才能从根本上摆脱受制于人的技术格局。
第三，应集中力量在一些重点领域和关键环节上取得突破。他认为，当前最重要的要在关乎国家整体发展的节能技术研究上下功夫，力求取得突破。
第四，加大科学技术重大基础设施建设的投入，为科技创新提供必要的物质保障，「特别是对一些国家重点实验室要加大支持力度，在经费投入和人员配备上优先考虑，为科技成果转化创造条件。」
第五，科技创新要有一定的体制保障。萧灼基认为，当前提倡自主创新，应以企业为主体而非以政府为主体，应以市场为导向而非以行政为导向，应走产学研相结合的道路，而非各行其是、相互脱节。这一切，都需要有良好的体制保障。
第六，政府要从财税制度上对自主创新行为给予激励，并实行政府采购制度，完善风险投资机制，支持创新的科学研究及创新成果的转化。
第七，应加强技术转让的中介服务。萧灼基指出，目前很多创新成果只能是论文成果、研究成果，而不能转化为生产成果、市场成果和效益成果，就是因为评估机构、转让机构等中介服务发展不完善，市场化运作不规范，导致创新的效益得不到充分的体现。
第八，加大知识产权保护力度。萧灼基表示，加强对侵权行为的打击，不仅出于减少贸易摩擦的需要，更主要是为创新活动提供强有力的保护，「这同时也是尊重知识、尊重人才、尊重创新的具体表现。」
第九，充分利用全球性的科技资源，把创新和引进有机结合起来。萧灼基认为，提倡自主创新并非要搞技术封闭，应取他人之长补自己之短，积极开展技术交流和交易。
第十，应将人力资源当作第一资源，把教育当作建设创新型国家、创新型社会的关键。他指出，良好的教育体系不仅能培养出大量科技领域的拔尖人才，也是提高全民族整体素质的必由之路，这就是建设创新型国家最重要的基础。
